Análise de bioinformática de alvos moleculares utilizados para identificação do Sars-CoV-2
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Data
2025
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Editor
Universidade Federal do Oeste da Bahia
Resumo
Resumo : Introdução: O SARS-CoV-2 é um betacoronavírus que surgiu na cidade de Wuhan na China em meados de dezembro de 2019, provocando, consequentemente, a pandemia da COVID-19. Nesse sentido, com o sequenciamento do genoma viral, conjuntos de primer e sondas foram criadas para o diagnóstico molecular desse agente etiológico. Entretanto, com a propagação do vírus pelo mundo, mutações foram surgindo dando origem a novas variantes. Nesse contexto, surgiu-se o questionamento se essas novas variantes invalidavam os testes moleculares amplamente utilizados. Objetivo: Este estudo tem como objetivo avaliar, através de ferramentas de bioinformática, se o surgimento das variantes do novo coronavírus afeta a detecção nas amostras dos pacientes testados pela técnica de RT-qPCR. Metodologia: Para isto, foram selecionados conjuntos de primers e sondas dos principais protocolos utilizados mundialmente que possuíam como alvos moleculares os genes E e NP, em seguida esses alvos foram testados através de ferramentas de bioinformática, visando testar sua viabilidade ou não. Resultados: Através deste estudo, identificou-se que a maioria das mutações ocorrem fora dos principais alvos moleculares utilizados nos kits de diferentes protocolos distribuídos mundialmente, além disso se trata de mutações do tipo pontual que interferem pouco no processo de pareamento dos conjuntos de primers e sondas usados no diagnóstico molecular. Ademais, as mutações não estão fixadas em todas as variantes da nossa amostragem Conclusão: Dessa forma, identificamos a validade dos alvos moleculares para a identificação do SARS-CoV-2 frente o surgimento das variantes de preocupação. Este trabalho é importante pois indica que alvos moleculares e protocolos de identificação viral por RT-qPCR para vírus podem ser mantidos, mesmo após o surgimento de muitas variantes.
Descrição
Trabalho de Conclusão de Curso apresentado ao
curso de medicina como requisito obrigatório para
obtenção de título de Médico pela Universidade
Federal do Oeste da Bahia.
Palavras-chave
SARS-CoV-2, COVID-19, RT-PCR, Bioinformática
Citação
PEREIRA, Wvelton Mendes. Análise de bioinformática de alvos moleculares utilizados para identificação do Sars-CoV-2. Barreiras, BA, 2024. 34f.: il. Monografia (Graduação) – Bacharelado em Medicina. Universidade Federal do Oeste da Bahia. Centro das Ciências Biológicas e da Saúde. Barreiras, BA, 2024.